Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NRXN3Q9Y4C0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms