Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms