Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZDHHC9Q9Y397 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms