Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DTX4Q9Y2E6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms