Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATF5Q9Y2D1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ATF5Q9Y2D1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms