Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
L1RE1Q9UN81 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms