Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SNX12Q9UMY4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SNX12Q9UMY4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms