Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PNMA8BQ9ULN7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms