Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLCO3A1Q9UIG8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms