Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DUX4Q9UBX2 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms