Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
VPS29Q9UBQ0 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
VPS29Q9UBQ0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms