Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNRD1Q9P1U0 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms