Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
EHD3Q9NZN3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
EHD3Q9NZN3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms