Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PODXL2Q9NZ53 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PODXL2Q9NZ53 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms