Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BSDC1Q9NW68 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BSDC1Q9NW68 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms