Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RRP7BPQ9NSQ0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RRP7BPQ9NSQ0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms