Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GOPCQ9HD26 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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