Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHOJQ9H4E5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms