Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CEP44Q9C0F1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CEP44Q9C0F1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms