Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM8Q9BZR9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms