Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GABARAPL3Q9BY60 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms