Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAPERQ9BY12 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms