Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RBBP8Q99708 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms