Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHOX2BQ99453 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms