Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSRNP1Q96S65 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms