Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CRAMP1Q96RY5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms