Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMG1Q96Q15 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMG1Q96Q15 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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