Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
MS4A3Q96HJ5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms