Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPNQ96H22 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms