Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
LIN37Q96GY3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LIN37Q96GY3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms