Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MTERF3Q96E29 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms