Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC59Q96AG4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC59Q96AG4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms