Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAD50Q92878 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms