Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXB13Q92826 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms