Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHF3Q92576 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHF3Q92576 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms