Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAAF4Q8WXU2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAAF4Q8WXU2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms