Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RHBDD1Q8TEB9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms