Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC4Q8TBB5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms