Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC197Q8NCU1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC197Q8NCU1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms