Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HJURPQ8NCD3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms