Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC4Q8N9L1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC4Q8N9L1 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms