Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLF2Q8IX21 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLF2Q8IX21 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms