Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC117Q8IWD4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms