Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
WDR53Q7Z5U6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
WDR53Q7Z5U6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms