Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATG9AQ7Z3C6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms