Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q71RC1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q71RC1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q71RC1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms