Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LETMD1Q6P1Q0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms