Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RCSD1Q6JBY9 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RCSD1Q6JBY9 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms