Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLX4IPQ5VYV7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms