Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
STRIP1Q5VSL9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRIP1Q5VSL9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms